OBJETIVO

DEL TRABAJO

ÍNDICE:

OBjetivos 

BÚSQUEDA DE SECUENCIAS

ALINEAMIENTO DE SECUENCIAS:

-Nucleoproteninas

-Proteinas de la  matriz

-Polimerasa

RESULTADOS Y CONCLUSIONES

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  Debido a las dificultades y discusiones que últimamente ha generado la clasificación taxonómica de las distintas variedades de virus Ébola y Marburg, el objetivo de nuestro trabajo será el de intentar establecer  las relaciones filogenéticas que existen entre estas tres familias de virus y demostrar que realmente los filovirus son suficientemente distintos como para asignarles  una familia separada. Las familias que analizaremos seran las siguientes:

  Familia Filoviridae

        - Ébola Zaire

        - Ébola Marburg

        - Ébola Reston

        - Ébola Sudan

 Familia Rhabdoviridae 

        - Virus de la Rabia (Rabies virus)

  Familia Paramyxoviridae

        - Virus de Measles (Measles virus)

        - Virus de las Paperas (Mumps virus)

        - Virus Parainfluenza Humano I (Parainfluenza virus)

        - RSV

 El trabajo consistirá en comparar la secuencia aminoacídica de distintas proteinas comunes en todos estos virus:

     1) Nucleoproteinas

     2) Proteinas de la matriz

     3) Polimerasas

  En primer lugar, se realizará una búsqueda por similitud mediante BLAST, partiendo siempre de las secuéncia de Ébola Zaire. Las secuéncias que no se encuentren de esa forma, se buscaran en GenBank. En segundo lugar y en base a los resultados obtenidos previamente, se realizará un alineamiento múltiple para cada grupo de secuéncias mediante ClustalW, y finalmente, se construirán tres árboles filogenéticos que nos permitirán sacar conclusiones y responder a las preguntas planteadas anteriormente.